Du point de vue des eaux superficielles, les enjeux diffèrent fortement selon que le réseau est souterrain ou aérien.
Ils sont limités, si le réseau est souterrain, aux intersections du fuseau avec les grands cours d’eau (Seine et Marne) dont la taille du lit mineur impose une profondeur minimale à la réalisation d’un tunnel. Ils portent sur la réalisation des ouvrages annexes et de leur incidence sur l’eau.
Si le réseau est aérien, les enjeux sont plus importants, car la dimension « milieux naturels » et « usage des cours d’eau (navigation) » entre en ligne de compte de façon plus importante.
Rappelons, par ailleurs, que les contraintes relatives tant aux eaux superficielles que souterraines ne sont pas que techniques mais aussi réglementaires.