Il convient d'attirer l'attention sur la mauvaise qualité des eaux du Rhône qui est toujours l'exutoire des rejets, certes traités la plupart du temps. Il en découle que le fleuve véhicule beaucoup de composés pouvant être très impactants, à long terme, sur les milieux et les usagers. Ainsi, l'utilisation des eaux du fleuve impose un traitement avant usage sinon les terrains irrigués ressembleront à des mini décharges sauvages. Le développement durable doit aussi prendre en compte ce type d'enjeux pour ne pas avoir, dans quelques années, des terres stériles ou des sols pollués.